购房合同备案和契税缴纳过程中，可能存在以下法律风险点。
1. 滞纳金风险：未按时缴纳契税，税务机关可能按日加收滞纳税款万分之五的滞纳金。例如，购房者未在规定时间内缴纳10万元契税，逾期30天则需缴纳滞纳金1500元（100000×
0.05%×30）。
2. 备案失败风险：因未缴纳契税或材料不全导致备案失败，可能影响后续房产证办理，甚至引发与开发商的合同纠纷。例如，开发商因购房者未备案成功而延迟交房，双方产生违约责任争议。
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关于购房合同备案与契税缴纳的关系，直接答案如下。
购房合同备案通常需要缴纳契税。

1. 若购买的是商品房预售房：签订预售合同后，需在备案前或备案时缴纳契税，这是多数地区办理备案的前置条件之一。
2. 若购买的是现房：签订现房销售合同后，办理合同备案前也需缴纳契税，否则可能无法完成备案流程。
3. 若存在地方特殊政策：部分地区可能允许在办理房产证前缴纳契税，但备案时仍需提供契税缴纳凭证或税务机关出具的相关证明。
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以下是可能影响购房合同备案及契税缴纳的特殊情况或例外情形。
1. 地方契税减免政策：部分地区对首套房、保障性住房等实行契税减免或优惠，符合条件的购房者可按优惠税率缴纳，影响契税金额及备案材料要求。例如，首套房面积在90平方米以下的，契税税率可能减按1%征收。
2. 不可抗力因素：如因自然灾害等不可抗力导致无法按时缴纳契税，购房者可向税务机关申请延期缴纳，此时备案时间也可能相应顺延。
3. 特殊房屋类型：购买经济适用房、拆迁安置房等特殊房屋，契税缴纳和备案流程可能与普通商品房不同，需遵循专项政策规定，影响办理时间和材料要求。
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针对购房合同备案需缴纳契税的直接回复，以下结合具体法律依据进行分析。
根据《中华人民共和国契税暂行条例》第一条规定：“在中华人民共和国境内转移土地、房屋权属，承受的单位和个人为契税的纳税人，应当依照本条例的规定缴纳契税。” 购房合同备案是房屋权属转移的前置程序，此时房屋交易已实质发生，承受方（购房者）作为契税纳税人，需按规定缴纳契税。该条例明确了契税的缴纳义务产生于权属转移行为，而购房合同备案是权属转移的关键环节，因此备案时缴纳契税符合法律规定。适用结论：购房合同备案时，购房者应依法缴纳契税，否则可能影响备案及后续权属登记。

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